Patoloji laboratuvarı ilk defa 1949 yılında enstitü bünyesinde açılmış olup, şefliğine Dr.Fahri HAKİOĞLU atanmıştır. Bu nedenle 1994 yılında laboratuvarın adı Dr.Fahri Hakioğlu olarak değiştirilmiştir. 1968 yılında FAO Koyun Hastalıkları Araştırma Laboratuvarları bünyesine alınmıştır.

a)      Teşhis ile ilgili tüm laboratuvarlar  işbirliği halinde çalışarak histopatolojik muayenelerle,

b)     Enstitümüze bağlı illerden, Tarım İl ve İlçe Müdürlükleri ve yerel yönetimler kanalı ile gönderilen veya vatandaşlarca elden getirilen şüpheli vakalarda diğer laboratuvarlarla işbirliği halinde  teşhisi yapılmaktır.

c)      Konusuyla ilgili bilimsel çalışma ve bunlara ait yayım çalışmaları yapmaktan